Nodes are publications, genes, proteins, variants, diseases, biological processes, drugs, evidence records and hypotheses of a research case. Solid lines are documented connections; dashed lines are hypotheses still under review. No connection is inferred from word co-occurrence.
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Research case
Gene
Protein
Variant
Disease
Biological process
Drug / compound
Evidence record
Publication
Hypothesis
Documented connection
Under review
Evidence record
Rapamycin in human fibroblasts: BUB1B locus RNA signal
The primary BUB1B-spanning feature has a Rap/Pro mean ratio of 0.585706 (41.43% lower); reduced-serum/Pro is 0.186191. Three nearly full-span features give the same direction. This does not support an RNA-abundance-increase rationale for sirolimus in this model.
Evidence-guided drug repurposing. Explore how two germline BUB1B variants raise separate RNA and protein questions in mosaic variegated aneuploidy, and which evidence could inform …
Functional CFTR evidence supports investigating amlexanox, but negative NEFL rescue with neurite toxicity and context-dependent NMD responses prevent promotion to an established le…
No exact L737* measurement or exact six-flanking-base match in the 5,837-PTC table. Twelve nearest contexts have a median paired gentamicin increment of 0.0165 percentage points.
No direct BUBR1 or N1002K rescue evidence was located in the audit. Heat-shock responses are context-dependent; arimoclomol is not promoted to lead candidate.
Genetic senescent-cell ablation delayed selected phenotypes in BubR1-deficient mice; uPAR CAR T benefits came from other mouse models. HER2 CAR T and nivolumab/ipilimumab show limi…
No exact-N1002K functional experiment was located. I909T/L1012P checkpoint rescue at matched abundance makes an abundance-limited mechanism plausible, but equally expressed B56-bin…
Montelukast has a published permutation q of 0.021150, but the response is reporter-dependent and confounded by non-NMD isoform changes. No hit establishes functional BUBR1 rescue.
A related 731X construct motivates testing whether L737* retains useful function when NMD is bypassed. The exact L737* experiment has not been performed.
G418/ELX-02 with or without mefloquine were studied beyond reporters, including endogenous PKD1 protein and withdrawal measurements. This does not establish gentamicin-combination …
The primary BUB1B-spanning feature has a Rap/Pro mean ratio of 0.585706 (41.43% lower); reduced-serum/Pro is 0.186191. Three nearly full-span features give the same direction. This…
The synthetic fixture flags fewer raw error-positive divisions without a lower error rate per completed division. It does not measure sirolimus activity.
Amlexanox and montelukast remain conditional; gentamicin plus mefloquine remains an experimental branch. No exact-genotype pharmacological rescue is established.
BioLab es el área de investigación biomédica de Stackfire Labs: casos de investigación construidos sobre evidencia abierta, reanálisis reproducibles y un registro explícito de lo que sigue sin resolverse. Organiza evidencia y propone experimentos; no realiza experimentos con pacientes ni recomienda tratamientos.
Dos variantes germinales de BUB1B en la aneuploidía variegada en mosaico plantean preguntas distintas: L737* es una pregunta de ARN y traducción; N1002K, una de estabilidad y función de la proteína. El caso registra reanálisis y auditorías de evidencia, una auditoría de robustez del 24 de octubre de 2026 y una matriz de decisión de candidatos. No hay rescate farmacológico establecido para el genotipo exacto; la validación de laboratorio sigue siendo trabajo futuro.
Un caso de investigación educativo sobre cáncer de ovario. Mantiene aparte lo que ocurrió, lo que está documentado, lo que estaba disponible en su momento, lo que se sabe hoy y lo que sigue siendo experimental. Su contenido clínico se publica solo después de una revisión y una aprobación explícita; hasta entonces las secciones muestran su estructura con estados vacíos honestos. Es una referencia educativa, no consejo médico individualizado.
Una biblioteca de investigación compartida de publicaciones guardadas como referencias, no como copias. Cada entrada enlaza a su fuente original y registra qué servicios bibliográficos públicos aportaron sus metadatos y cuándo. Los estados de lectura y las colecciones son organización bibliográfica, nunca validación científica.
El grafo conecta un caso con sus variantes, procesos, registros de evidencia, publicaciones e hipótesis. Las líneas continuas son conexiones documentadas; las discontinuas, hipótesis en revisión. Una conexión dice que una fuente o un registro vincula dos elementos: no es evidencia de causalidad ni de eficacia. Cada vista tiene también una alternativa en lista.
Una ruta de investigación es una lectura ordenada de la evidencia, paso a paso. Las hipótesis son afirmaciones en investigación con la evidencia que las informa o las limita; ninguna está marcada como validada. Los huecos de evidencia nombran lo que no se ha medido o localizado. Todos enlazan a registros y publicaciones existentes en lugar de copiarlos.
El registro auditable de los reanálisis de MVA con sus registros de ejecución y descargas, y un explorador de estructura de proteínas del modelo predicho de BUBR1. Las herramientas marcadas como planeadas aún no están construidas. Los reanálisis de datos públicos procesados y las estructuras predichas no son experimentos biológicos.
No. BioLab es contexto de investigación, no un informe diagnóstico clínico ni una recomendación de tratamiento. Los candidatos a fármaco son hipótesis de investigación con compuertas explícitas, no tratamientos probados. Las preguntas sobre la atención de una persona corresponden a su equipo clínico.
